J-GP3の決勝は波乱の展開となった。ウォームアップランで予選2番手につけていた山本剛大が90度コーナーでまさかの転倒。グリッドにつくことができず、そのままレースはスタートする。菊池寛幸が鮮やかにホールショットを奪い、大久保光、森俊也、浦本修充、篠崎佐助らが続くが、オープニングラップの5コーナー立ち上がりで転倒したライダーと車両がコース上をふさいだため、赤旗が提示される。

　レースは仕切り直しとなるが、山本はマシンの修復が間に合わずグリッドにつけない。セカンドグリッドが空席のまま、2度目のスタートが切られ、ホールショットを大久保が奪う。オープニングラップは大久保、浦本、森、菊池、鎌田、篠崎佐の順にコントロールラインを通過。ほぼ全車が1周をラップしたころ、マシンの修復が終わった山本がようやくコースインしレースに加わる。

　一方、トップ争いのまっただ中にいた篠崎は6番手を走行中、3周目の最終コーナーでハイサイドを起こし、まさかの転倒、リタイアとなってしまう。その後、トップ争いは森、大久保、浦本、菊池、鎌田の5台が形成。しかし、前日の公式予選で転倒し左の足首を痛めていた鎌田は、うまくシフトチェンジができず5周目のビクトリーコーナーでギア抜けを起こし、トップ争いから脱落してしまう。

　4台となったトップ争いは、その後も何度も順位を入れかえる激しいバトルを繰り広げる。最終ラップ、最終コーナーを真っ先に立ち上がったのは大久保。菊池は並んでメインストレートに戻ってくるが、僅かに大久保が先にコントロールラインを通過、この接戦を制し、今季2勝目を挙げた。タイム計測では、2位の菊池との差は0.000秒と計測できないほどの僅差だった。3位には菊池と0.340秒差で浦本が入り、森は0.074秒差で惜しくも4位となった。

　5位争いは徳留真紀が制し、野佐根航汰、日浦大治朗が僅差で続いた。レース序盤にトップ争いに絡んでいた鎌田は8番手を走行していたが、最終ラップの3コーナーで転倒し、チェッカーを受けることができなかった。
　山本はトップから1ラップ遅れでレースを終えたが、11周目にファステストラップとなる2分02秒096をマークし意地を見せた。

　優勝した大久保はポイントを99.5に伸ばしタイトル獲得に王手をかけた。森が77ポイント、菊池が72.5ポイントで大久保を追っている。64.5ポイントを保持している山本はポイントを加算することができず、チャンピオン争いからは脱落してしまった。

優勝／#6　大久保 光　18 GARAGE RACING TEAM
『チームの方々と関係者、スポンサーの皆さまに感謝したい気持ちでいっぱいです。ボクのマシンは速かったので最初から有利ではあったんですけれど、勝てたことがとてもうれしいです。今回は、ランキングを考えないで走っていました。鈴鹿は好きなサーキットなので、次のMFJ-GPも、この勢いを生かして勝てるように頑張りたいと思います』

2位／#1　菊池 寛幸　WHEELIE with KRT
『今年は（富沢）祥也の事故もあり、自分の中で整理がつかず、どうしていこうか悩んでいました。若手ライダーの安全を、どうやって確保していくのかも考えて、これからも頑張っていきたい。今回、一緒に争った4台も、みんないい走りをしていた。タイヤの状況もよく、スタッフも頑張ってくれました。本当は1番になって、祥也に報告できたらなと思っていましたけれど、久しぶりに、ここ（表彰台）に戻って来られてよかったと思います』

3位／#13　浦本 修充　MuSASHiRTハルク・プロ
『まずはチームの方々とスポンサーの方々、HRCの方々に本当に感謝したいと思います。レースウイークに入って最初の走行で転倒してしまったときは、流れが変わってしまうかなと思った。予選はあまり調子がよくなかったけれど、決勝朝のウォームアップ走行で“ああ、このマシンなら戦えるな”という手応えがあった。あとはスタートを決めて、どんどん前に行こうと思っていたので、勝てなかったのは悔しいけれど、1年以上ぶりの表彰台なので素直にうれしいですね。次の鈴鹿は表彰台の一番高いところに上れるように頑張りたいと思います』